现在的南京医科大学，拥有一级学科博士学位授权点8个、二级学科博士学位授权点54个、交叉学科博士学位授权点5个、专业博士学位授权点2个；一级学科硕士学位授权点11个、二级学科硕士学位授权点65个；博士后科研流动站6个。
在教育部的第四轮学科评估中，南京医科大学一共有6个学科参评，其中，公共卫生与预防医学获得A+，全国排名数一数二；其余的5个学科基础医学、口腔医学、临床医学、护理学等均为B类。
南京医科大学既不是211也不是985。南京医科大学是教育部、中华人民共和国国家卫生健康委员会、江苏省共建高校和江苏高水平大学建设高校，是教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校。
南京医科大学简介：
南京医科大学（Nanjing Medical University）是教育部、中华人民共和国国家卫生健康委员会、江苏省共建高校和江苏高水平大学建设高校，是教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校、国家建设高水平大学公派研究生项目实施高校、国家“特色重点学科项目”建设高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、江苏省高层次人才培养计划“333工程”培训基地，长三角医学教育联盟创始成员。