赣州第三医院康复中心住院医保报销的比例会根据具体的病情和治疗方案而有所不同。一般来说，医保会根据医疗费用的实际发生情况进行相应的报销。

对于住院患者，医保通常会按照规定的比例对医疗费用进行报销。这些比例因地区和政策的不同而有所不同，需要具体咨询当地的医保政策或相关部门。

在赣州第三医院康复中心住院，具体的报销比例还需要根据该中心的医保政策以及患者的具体情况来确定。建议患者在办理入院手续前，向该中心的医保部门或相关科室咨询具体的报销比例和相关政策。