有区别，区别在于，防疫证明和检疫证明都是与进出口商品检疫相关的文件，但它们的用途和内容略有不同。
防疫证明是针对进口商品的，证明该商品已经过境该国的口岸，并且符合该国的防疫要求。在某些情况下，防疫证明也可以用于证明商品经过HFQ（卫生检疫）和WS（植物检疫）检验，符合该国的相关标准。
检疫证明则是在商品进入一个国家或地区时签发的，证明该商品符合该国的检疫要求，并且已经通过相应的检验。检疫证明通常包括商品的名称、数量、包装方式、生产厂家等信息，以及检验标准和日期等。
因此，防疫证明和检疫证明的主要区别在于证明的对象和内容不同。防疫证明用于证明商品进口符合该国的防疫要求，而检疫证明用于证明商品符合该国的检疫标准。
1.提出申请：符合条件的场所，填写《动物防疫条件合格证申请表》，提出申请。
2.受理：县（区）农业农村局在收到申请后，审查提交的材料是否规范齐备，齐备的出具《受理通知书》，不齐备的告知申请人需要补正的全部内容。
3.审查：根据申请人提交的材料内容，到现场进行实地勘察，与所报材料相符的，写出实地勘察报告，交主管负责人审核，与申请材料不相符的，将申请材料退回中心受理人员，并以书面形式说明理由。
4.审批：进一步审查后，会议审批或领导签批。
5.出件：符合许可条件、标准的，出具批准文件、批复或证照，不符合许可条件、标准的，不予签发许可决定，将其申请材料全部退回受理中心，并以书面形式说明理由。