杂交育种的原理是:基因重组（或异源DNA重组）。
杂交育种是将两个或多个品种的优良性状通过交配集中在一起，再经过选择和培育，获得新品种的方法，杂交可以使双亲的基因重新组合，形成各种不同的类型，为选择提供丰富的材料。
杂交育种可以将双亲控制不同性状的优良基因结合于一体，或将双亲中控制同一性状的不同微效基因积累起来，产生在各该性状上超过亲本的类型，正确选择亲本并予以合理组配是杂交育种成败的关键。
杂交育种和选择育种是两种不同的育种方法，其差别体现在以下三个方面。
1. 杂交育种是通过不同品种之间的交配，将各自的优点集中起来，创造出后代中更好的品质和特性；而选择育种则是在同一品种内，通过选择最优秀的个体进行繁殖来逐渐改良品种。
2. 杂交育种得到的后代不容易出现衰退，因为交配的双方有着不同的遗传基因，能够互相补充弥补不足，而选择育种则需要不断地筛选最优秀的个体，以逐步提升品种的综合素质。
3. 杂交育种适用于对物种的改良，而选择育种则适用于对同一物种的改良，应用的范围略有不同。
杂交蛇是指由不同品种的蛇进行人工杂交而产生的新品种蛇。常见的杂交蛇品种有各种颜色的花环蛇、铃纹蛇、黑尾竹叶青蛇、紫金蟒、虎皮蟒、过山飞龙等。这些蛇品种不仅具有新颖的外观，还具有多种性状的优点，例如更适应环境、更长寿、更健康、更温顺等。但同时也需要注意的是，杂交蛇在繁殖上较为困难，且具有不同品种遗传特征的杂交蛇后代也往往存在遗传缺陷。