黄河之所以不进入黄海而是注入渤海，主要是受到地质构造和海陆形成的影响。黄河流经山西、河南等地区，在其下游流经的山东半岛是一片地势低平的平原，这使得黄河流域的地表高度低于周边山地。
另外，黄河入海口所处的地理位置也有重要的影响，渤海是东北亚地区重要的淡水湖，而黄海则是一片咸水海域，黄河流经东北亚地区后注入渤海，借助渤海淡水的稳定，使得黄河水流及沿岸区域得到了良好的水资源保障，对当地农业生产等方面都起到了积极的作用。
黄河没有形成发达的内河航运的原因是与其他大江大河相比，黄河中游的通航条件有其特殊的困难和局限之处。
1、黄河中游航运的壶口瀑布是航运障碍之一。在壶口瀑布“旱地行船”成本太高；且如果在壶口瀑布西侧建船闸，极有可能会严重破坏壶口风景区的自然景观。
2、黄河天然径流量随着时间正在大幅度减少，下游断流发展态势令人十分担忧，黄河中游的航运业因此也受到很大影响。
3、黄河托克托至禹门口段两岸是黄土高原，水土流失严重，支流汇入将大量泥沙带入河道，使得河水含沙量大增，增加了航运的阻力。
4、黄河潼关至三门峡段位于晋陕豫黄土峡谷之中，河道较为顺直。由于受潼关上游河道河床游荡以及三门峡水库自身运用的影响，潼关——大禹渡段(40km)浅滩密布，主流(槽)多变，行船困难。
5、黄河小浪底至古柏嘴，属于峡谷向平原的过渡性河段，铁谢以下河道较为分散，通航条件较差。